Какова цель META-INF?

Вообще говоря, вы не должны javax ничего вкладывать в META-INF java-se самостоятельно. Вместо этого java вы должны полагаться на то, что oraclejdk вы используете для упаковки java-libraries вашего JAR. Это одна из областей, где jre Ant действительно преуспевает: указание j2se атрибутов манифеста JAR-файла. Очень oraclejdk легко сказать что-то вроде:

По j2se крайней мере, я думаю, что javax это легко... :-)

Дело в том, что .java META-INF следует считать java-se внутренней мета директорией Java. Не .java связывайтесь с этим! Любые java файлы, которые вы хотите .java включить в свой JAR, должны java быть помещены в какой-либо jre другой подкаталог или в корень jre самого JAR.