Какую базу данных вы бы порекомендовали использовать с приложением C# (.NET)?

Для быстрого и грязного я dbms бы выбрал Sql Server Compact Edition. Это внутрипроцессная .cs-file реализация Sql Server, поэтому c-sharp она не требует установки dbms каких-либо других приложений.

Раньше database для таких вещей использовали database-structure базу данных Access. А вот dotnet с базами данных Access все database в порядке.

Загрузка готовых csharp данных обратно на рабочий dot-net сервер не займет много времени. Если c-sharp вы ищете решение, которое c#-language автоматизирует этот процесс, вам, вероятно, придется .cs-file посмотреть на локальный хостинг databases экземпляра MySql и использовать c#-language любые службы репликации, которые .net он предоставляет.