Как создать подключаемую программу Java?

Загляните в OSGi.

С одной стороны, OSGi core-java предоставляет всевозможную jdk инфраструктуру для управления, запуска j2se и выполнения многих других core-java задач с помощью модульных java-api программных компонентов. С jre другой стороны, он может openjdk быть слишком тяжелым для oraclejdk ваших нужд.

Между прочим, Eclipse java-api использует OSGi для управления core-java своими плагинами.